洁净室按用途分类（可分为两大类）工业洁净室和生物洁净室。工业洁净室以无生命微粒的控制为对象。主要控制空气尘埃微粒对工作对象的污染，内部一般保持正压状态。生物洁净室主要控制有生命微粒（细菌）与无生命微粒（尘埃）对工作对象的污染。洁净室的应用形式多种多样，下表中列出当前应用洁净室的一些工业领域。
洁净室设计最基本的规范：
一、应在大气含尘浓度较低，自然环境较好的区域；
二、应远离铁路、码头、飞机场、交通要道以及散发大量粉尘和有害气体的工厂、贮仓、堆场等有严重空气污染、振动或噪声干扰的区域。如不能远离严重空气污染源时，则应位于其最大频率风向上风侧，或全年最小频率风向下风侧； 三、应布置在厂区内环境清洁、人流货流不穿越或少穿越的地段。
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